ECOTONO ha prestado asistencia externa a diversas administraciones de ámbito estatal, autonómico y local.

Asimismo, ha trabajado en coordinación con Grupos de Desarrollo Rural de numerosas comunidades autónomas para la evaluación y puesta en marcha de distintos programas europeos (PRODER, LEADER, EQUAL )

Especial atención merecen los Espacios Naturales Protegidos para los que ECOTONO ha desarrollado proyectos relacionados con la gestión de su uso público, turismo sostenible, implantación de sistemas de calidad, estudios de capacidad de acogida, etc.